Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins4Q99LZ3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gins4Q99LZ3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gins4Q99LZ3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms