Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2aQ99KJ0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms