Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdcbp2Q99JZ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms