Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab29Q91YQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rab29Q91YQ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms