Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TgdsQ8VDR7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms