Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops8Q8VBV7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms