Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms