Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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