Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms