Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog3Q8CI04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog3Q8CI04 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog3Q8CI04 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cog3Q8CI04 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms