Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms