Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms