Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrip1Q8CBD1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms