Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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