Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms