Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PgghgQ8BP56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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PgghgQ8BP56 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PgghgQ8BP56 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms