Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolrmtQ8BKF1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms