Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms