Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc181Q80ZU5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms