Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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