Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Zbed4Q80WQ9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zbed4Q80WQ9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms