Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnma8aQ80VM8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pnma8aQ80VM8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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