Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms