Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms