Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp17leQ7M764 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms