Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Papd7Q6PB75 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms