Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac10Q6P3E7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac10Q6P3E7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms