Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms