Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf4Q64287 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms