Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms