Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms