Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtmQ62388 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AtmQ62388 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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AtmQ62388 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtmQ62388 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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