Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Taf6Q62311 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Taf6Q62311 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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