Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ift88Q61371 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms