Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Astn1Q61137 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Astn1Q61137 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms