Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim1Q61045 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sim1Q61045 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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