Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3aQ60520 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms