Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms