Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms