Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms