Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1nQ497L1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2al1nQ497L1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms