Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933416C03RikQ3V063 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms