Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms