Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam172aQ3TNH5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam172aQ3TNH5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms