Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne7Q0VE82 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms