Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms