Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Apoc2Q05020 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms