Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Crisp3Q03402 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms