Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms