Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AlkP97793 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AlkP97793 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AlkP97793 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AlkP97793 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms